Większość substancji zawartych w środkach ochrony roślin ma działanie szkodliwe, dlatego po wykorzystaniu preparatu puste opakowania powinny być odpowiednio magazynowane i przetwarzane. Na etykiecie każdego produktu znajdują się informacje o niebezpieczeństwach lub zagrożeniach, jakie może on stwarzać, wskazując jednocześnie sposób postępowania z opakowaniem.
Kategorycznie zabronione jest palenie opakowań po środkach niebezpiecznych, wrzucanie ich do odpadów komunalnych oraz wykorzystywanie ich do innych celów. Zgodnie z wymogami prawnymi, powinny być one odpowiednio zagospodarowane, czyli zwrócone, opłukane i czyste do punku sprzedaży, gdzie zostały zakupione.
Istnieje również inna możliwość postępowania z użytym opakowaniem po środkach ochrony roślin -oddanie ich do Punktu Selektywnego Zbierania Odpadów Komunalnych (PSZOK) znajdującego się przy ul. Przemysłowej 16 w Ustrzykach Dolnych.
Można również gromadzić opakowania po środkach ochrony roślin w szczelnym pojemniku lub w worku koloru czerwonego, z dala od pasz przeznaczonych dla zwierząt oraz w miejscach niedostępnych dla dzieci. Nagromadzone opakowania będą odbierane dwa razy w roku, w miesiącach maj i wrzesień, w dniach odbioru odpadów komunalnych oddzielnym transportem.